金沢大学疾患モデル総合研究センター

研究基盤支援施設Bioscience Core Facility

アジレント社製マイクロアレイ受託解析のご案内

アジレント社の各種マイクロアレイ (mRNA, miRNA, CGH等)の受託解析を学内外より広く請け負っております。アジレント社のマイクロアレイは，5logのシグナルレンジを持ち，低発現遺伝子の検出も可能となっております。

スキャナーのバージョンアップにより，8x60k等の高密度アレイを含め，アジレント社製の全てのアレイに対応出来るようになりました。また，ヒトやマウスだけでなく，様々な生物種（ラット，ウシ，ネコ，マーモセット，メダカ，植物等）に対応可能です。

≪マイクロアレイ受託解析の流れ≫

  1. 最初に解析内容等を、担当：堀家に〈sihorike@staff.kanazawa-u.ac.jp〉メールでご連絡ください。
  2. 受託解析されることが確定いたしましたら

    を必ずメールに添付してご依頼ください（cc: 富樫＜makura@staff.kanazawa-u.ac.jp＞）

    4x44k, 8x60k mRNAマイクロアレイ解析

    1. RNAの準備（利用者に準備いただいておりますが，RNA調製に不安のある場合はご相談ください）
    2. TapestationによるRNAサンプルの品質チェック（RINの算出）
    3. Cy3あるいはCy5によるラベル化（取り込み効率のチェック）
    4. ハイブリと洗浄，スキャニング及び数値化と実験結果の品質チェック
    5. GeneSpringGXによる解析（サンプル間での比較解析，GO解析，GSEA解析等）を行います。
    6. 論文化の際には，GEOへのデータベース登録の代行作業も行なっております。

    受託解析の利用に際し，担当教職員との学術的な共同研究をお願いしております。

    利用料金については下記のようになります。1枚のアレイスライドには，通常4または8個のアレイが搭載されております。

    その他のアレイに関してはお問合せください。